La Sección de Ejecución y Control cumple las siguientes funciones
Llevar el registro y movimiento de las apropiaciones presupuestales;
Elaborar los proyectos de traslados presupuestales;
Elaborar proyectos de acuerdos mensuales de gastos;
Ejecutar el presupuesto, de acuerdo con las apropiaciones determinadas por disposiciones legales; y
Intervenir en la tramitación del pago de las prestaciones sociales de cargo del Ministerio de Defensa Nacional.