La dirección de la Caja de Vivienda Militar estará a cargo de la junta directiva y la administración de la misma corresponde al Gerente y al Subgerente. La Junta Directiva de la Caja quedará constituída así: por el Ministerio de Guerra, quién la presidirá; por el Comandante General de las Fuerzas Armadas; por los Comandantes del Ejército, la Armada y la Aviación y por el Jefe del Departamento de Control y Ejecución del Presupuesto de Guerra. El Gerente de la Caja será el mismo del Instituto de Crédito Territorial. El Subgerente de la Caja será nombrado por la Junta Directiva de la misma para periodos de un (1) año, pudiendo ser reelegido. Corresponde al Gerente, lo mismo que al Subgerente la representación legal de la Caja como persona jurídica, en todos sus actos.
La Auditoría de la Caja quedará a cargo de la Superintendencia Bancaria.