ARTICULO 10. ESTRUCTURA.- El Ministerio de Transporte tendrá la siguiente estructura
Despacho del Ministro 1.1. Oficina de Informática 1.2. Oficina Jurídica. 1.3. Oficina de Planeación 1.4. Oficina de Control Interno
Despacho del Viceministro
Secretaría General 3.1 Subdirección Administrativa 3.1.1 División de Servicios Generales y Mantenimiento. 3.1.2 División de Adquisiciones y Contratos 3.2 Subdirección Financiera 3.2.1 División de Presupuesto y Contabilidad 3.2.2 División de Pagaduría 3.3 Subdirección de Recursos Humanos 3.3.1 División de Administración de Personal 3.3.2 División de Capacitación y Bienestar social.
Dirección General de Transporte y Tránsito Terrestre Automotor. 4.1 Subdirección de Transpone de Carga 4.2 Subdirección de Transporte de Pasajeros 4.3 Subdirección de Transpone Internacional 4.4 Subdirección de Tránsito y Seguridad Vial
Dirección General de Transporte Ferroviario
Dirección General de Transporte Marítimo
Dirección General de Transporte Fluvial 7.1 Subdirección de Tráfico Fluvial 7.1.1 Divisiones de Cuencas Fluviales 7.1.2 Inspecciones Fluviales 7.2 Subdirección de Infraestructura Fluvial 7.2.1 División de Programación Fluvial 7.2.2 División de Estudios e Investigaciones Fluviales
Dirección General de Transporte Aéreo.
Dirección General de Vías e Infraestructura 9.1 Subdirección de Infraestructura Vial 9.2 Subdirección de Caminos Vecinales
Órganos de Coordinación y Asesoría 10.1 Consejo Sectorial de Transporte 10.2 Comité de Transporte Multimodal 10.3 Junta de Licitaciones y Contratos 10.4 Comisión de Personal