La Junta Directiva del Instituto estará integrada por
El Ministro de Educación Nacional o su delegado permanente, quien la presidirá.
Un representante del Ministerio de Salud.
Un representante del Ministerio de Defensa.
Un representante de la Asociación Colombiana de Universidades;
El Director del SENA o su representante.
Dos representantes de las organizaciones y asociaciones deportivas nacionales reconocidas por el Ministerio de Educación y designados por sus Presidentes.
Dos representantes de las organizaciones y asociaciones juveniles de carácter nacional reconocidas por el Ministerio de Educación Nacional y designados por sus Presentantes.
El Director Ejecutivo del Instituto formará parte de la Junta Directiva con derecho a voz pero no a voto.
Los períodos de los miembros que no representan a entidades oficiales, será de dos años.