Son funciones del Director del Fondo de Fomento Agropecuario, las siguientes
Velar por el cumplimiento de los objetivos y funciones asignados al Fondo;
Administrar el Fondo bajo la dirección del Ministro de Agricultura;
Establecer, para la aprobación del Ministro, el programa de prioridades que debe orientar la asignación de los recursos del Fondo;
Ordenar y dirigir la programación y elaboración del proyecto de presupuesto de la Unidad, teniendo en cuenta las metodologías que señale el Gobierno Nacional a través de la Dirección General de Presupuesto del Ministerio de Hacienda y del Departamento Nacional de Planeación;
Presentar para aprobación del Ministro de Agricultura el proyecto de presupuesto, anexando mediante mensaje escrito los supuestos y las bases de cálculo empleados en su elaboración;
Ejecutar el Presupuesto de ingresos y gastos de la Unidad;
Hacer evaluación y seguimiento en la ejecución de los recursos asignados por el Fondo.