El presupuesto de gastos de funcionamiento se compone de:
Gastos por servicios personales, gastos generales y transferencias. Los servicios personales comprenden: sueldos de personal de nómina, gastos de representación, sueldo de personal supernumerario, remuneración por servicios técnicos, honorarios, jornales, horas extras y días feriados, prima de navidad, prima técnica, prima de vacaciones, prima de servicios, bonificación por servicios prestados, otras primas, subsidio familiar, indemnización por vacaciones y auxilio de transporte.
Los gastos generales comprenden: mantenimiento y aseguros, compra de equipo, viáticos y gastos de viaje, servicios públicos, servicios de comunicaciones, materiales y suministros, impresos y publicaciones, arrendamientos, sostenimiento de semovientes, impuestos, tasas y multas, primas de pólizas y manejo y gastos varios e imprevistos.
Las trasferencias comprenden pagos de previsión social y aportes. Los pagos de previsión social se dividen en: pensiones, cesantías y servicios médicos.