Los límites de la Comisaria Especial del Putumayo serán los siguientes: desde el nacimiento del rio Cascabel, por el curso de este rio hasta su confluencia con el rio Caquetá; por este rio aguas abajo hasta la boca del rio Puré , Cure o rio Jacaré; por este rio aguas arriba hasta sus cabeceras y de este punto una línea recta imaginaria hasta la confluencia del rio Igaraparaná con el rio Putumayo; por la vaguada del rio Putumayo aguas arriba hasta la boca del Cuhimbe o Cuembí, y por el meridiano de esta boca hasta donde corta el rio San Miguel o Sucumbíos y por este rio, aguas arriba hasta el cerro Pax; de este punto por el divorcio de las aguas de las hoyas de los ríos San Miguel y Chingual o Chunquer y en seguida por el divorcio de aguas entre los ríos orientales y los que van al Pacifico, hasta el nacimiento del rio Cascabel, punto de partida.
La capital de dicha Comisaria seguirá siendo Mocoa.