Además de las consagradas en la Constitución Política, relacionadas con la Seguridad y Defensa Nacional, corresponde al Presidente de la República respecto al Sistema:
Dirigir los campos del Poder Nacional;
Aprobar el Plan de Seguridad y Defensa Nacional;
Aprobar los Documentos Primarios sobre Seguridad y Defensa Nacional;
Aprobar los Planes de Guerra presentados por el Consejo Superior de Seguridad y Defensa;
Ordenar los Planes de Movilización y Desmovilización Nacional;
Aprobar la Estrategia de Seguridad y Defensa Nacional;
Las demás funciones que le asignen la ley y los reglamentos.