Son funciones de lo Comisión Nacional las siguientes:
Elaborar y aprobar su reglamento interno.
Crear un comité técnico asesor, definirle sus funciones, su conformación y dictar su reglamento interno.
Aprobar la ejecución de los proyectos del Programa Nacional de Prevención, Mitigación, Erradicación, Contención y Renovación de la Marchitez por Fusarium R4T de plátano y banano (musáceas) y sus modificaciones.
Llevar a cabo el seguimiento y evaluación a la ejecución del presupuesto de inversión del Programa Nacional de Prevención, Mitigación, Erradicación, Contención y Renovación de la Marchitez por Fusarium R4T de plátano y banano (musáceas).
Recomendar los programas regionales de prevención, vigilancia y control de la Marchitez por Fusarium R4T del plátano y banano (musáceas).
Diseñar y poner en funcionamiento el plan de seguimiento y evaluación de los programas regionales.
Recomendar regulación relacionada con la prevención, mitigación, erradicación, contención y renovación de la Marchitez por Fusarium R4T del plátano y banano (musáceas).
Promover la conservación de zonas libres de Marchitez por Fusarium R4T del plátano y banano (musáceas).
Recomendar el establecimiento de puestos de control fitosanitarios.
Las demás que sean necesarias para el logro de sus objetivos.