El Rector de la Universidad del Ministerio Público es el representante legal de la entidad y la primera autoridad ejecutiva de la misma.
El periodo del rector será de 3 años y podía ser reelegible por una única vez.
El Rector de la Universidad del Ministerio Público será designado por una sola vez por el Procurador General de la Nación, por un término de tres años. Una vez vencido este término. el Consejo Superior Universitario será el competente para designar al Rector de conformidad con los estatutos.