Como órgano de dirección del Fondo Nacional de Fomento Hortifrutícola, actuará una junta directiva, integrada por:
El Ministro de Agricultura o su delegado, quien lo presidirá.
Dos representantes de las asociaciones de pequeños productores de frutas u hortalizas elegidos por la respectiva asociación gremial con personería jurídica vigente.
Un representante del Comité de Exportadores de Frutas, Analdex.
Un secretario de Agricultura Departamental o su delegado, elegido por el encuentro de Secretarios de Agricultura Departamentales.
Un representante de la Asociación Colombiana de Estudios Vegetales,
Un representante de la Asociación Colombiana de Ingenieros Agrónomos, ACIA.
Dos representantes de la Asociación Hortifrutícola de Colombia, Asohofrucol:
La Junta Directiva del Fondo podrá aprobar subcontratos de planes, programas yproyectos específicos con otras agremiaciones y cooperativas que le presente la entidad administradora del Fondo o cualquiera de los miembros de la Junta Directiva.