La Junta Directiva del ICFES está integrada por:
a)
El Ministro de Educación Nacional o su delegado permanente, quien la preside;
b)
El Rector de la Universidad Nacional de Colombia y en ausencia suya el vice- Rector de la misma Universidad;
c)
Dos rectores de las demás universidades oficiales, elegidos por la Asamblea de Rectores de dichas universidades oficiales;
d)
Dos rectores de las universidades privadas, elegidos por la Asamblea de rectores de universidades privadas.
e)
Un representante del Presidente de la República.