Para el cumplimiento de sus funciones, el Instituto Nacional de Medicina Legal y Ciencias Forenses tiene la siguiente organización básica:
Junta Directiva
Dirección General del Instituto
Oficina de Control Interno
Oficina de Planeación
Oficina Jurídica
Oficina de Control Disciplinario Interno
Secretaría General
Oficina de Personal
Subdirección de Investigación Científica
Escuela de Medicina Legal y Ciencias Forenses
Subdirección de Servicios Forenses
Subdirección Administrativa y Financiera
Direcciones Regionales
Direcciones Seccionales
7.1.1 Unidades Básicas.