Son funciones de la Junta Directiva las siguientes:
Elaborar los estatutos de la Corporación, los cuales serán sometidos a la aprobación del Gobierno Nacional.
Dictar el reglamento y el manual de funcionamiento de la Corporación, y adoptar, de acuerdo con su Director, su política administrativa.
Crear los cargos indispensables y señalar sus funciones y remuneración, con la aprobación del Gobierno Nacional.
Establecer cuáles de los servicios prestados por la Corporación deben ser retribuídos por medio de tasas y fijar su cuantía y modo de exigirlas, todo de acuerdo con las disposiciones legales vigentes.
Establecer cuáles de las obras de la Corporación darán lugar al gravamen de valorización; liquidar dicho gravamen y reglamentar su recaudo, todo de acuerdo con las disposiciones legales vigentes.
Autorizar o aprobar los contratos que celebre el Director Ejecutivo cuando su cuantía sea superior a cien mil pesos ($ 100.000.00).
Adoptar el presupuesto anual de ingresos, gastos e inversiones.
Adoptar planes y proyectos para el desarrollo de la región, conforme a las reglas que prescriba el Departamento Nacional de Planeación .
Comprometer a la Corporación en obligaciones de largo y corto plazo y pignorar los bienes de la Corporación cuando para el cumplimiento de sus funciones fuera menester, y
Darse su propio reglamento.